水利部最新调查评价结果显示，通过对4555个集中式饮用水水源地的调查，水质达标率为86％。其中，水库型水源地达标率为90．5％，地下水水源地为80．9％左右，河道型水源地为89％左右，湖泊为65％左右。
水利部负责此次调查的相关负责人告诉记者，地下水水源地水质不达标区域，主要分布在长江以北地区；地表水水源地水质不达标区域，主要在水污染较为严重的流域和地区。
“水源地水质不达标不仅增加制水工艺的复杂性，而且新出现的不达标将造成一些水厂原有净水工艺需要调整，增加建设和运行成本。更有甚者，有的水质不达标问题很难处理，影响水厂的良性运行和用户的饮水安全。”水利部农村饮水安全中心副主任闫冠宇说。
调查显示，我国水源地水质不达标的原因，既有自然因素，一些地区受资源条件限制，水质本底值存在超标情况；也有人为因素，水污染问题严峻，湖库型水源地富营养化问题日趋严重，大量重工业项目布设在大江大河沿岸，江河及周边的流动污染源风险较大，直接威胁水源安全。
据2013年水利系统监测资料，全国开展监测的20．8万公里重要江河河段中，全年Ⅰ－Ⅲ类水河长占68．6％，比2012年提高1．6％，但Ⅴ类及劣Ⅴ类河长仍有20．6％；全国开发利用程度较高和面积较大的120个主要湖泊全年总体水质Ⅰ－Ⅲ类有39个，占评价总数的32．5％；开展评价的5134个水功能区中，满足水域功能目标的2538个，占49．4％。
水利部称，目前全国仍有部分饮用水源保护区划分方案未获省级人民政府批复，特别是对跨行政区水源地，保护和受益主体不一致，保护责任和管理措施难以落实。水源地保护管理机制和能力有待完善提高，现行相关法律法规可操作性有待加强。随着城市发展、人口和排污越来越集中，水源保护面临更大压力。